تفاوت بین استگانوگرافی و رمزنگاری یک تمایز مهم برای هر کسی است که به دنبال ایمن سازی داده های حساس خود است. یکی از سردرگمی های رایج تفاوت بین پنهان کردن و رمزگذاری داده ها است. پنهان نگاری داده ها شامل پنهان کردن آن ها در یک شی دیگر، مانند یک تصویر یا فایل متنی است، در حالی که رمزگذاری داده ها شامل درهم ریختن آن ها است تا فقط توسط شخصی با کلید صحیح خوانده شود. استگانوگرافی نوعی پنهان کردن داده است، در حالی که رمزنگاری نوعی رمزگذاری داده است. مهم است به خاطر داشته باشید که اگرچه پنهان کردن داده ها ممکن است سطحی از امنیت را ارائه دهد، اما جایگزینی برای رمزگذاری نیست. اطلاعات رمزگذاری شده همچنان برای مهاجم قابل مشاهده است، اما آنها قادر به خواندن آن نخواهند بود. در مقابل، داده‌های پنهان می‌توانند برای مهاجم کاملاً نامرئی باشند، اما در صورت کشف آن‌ها همچنان قابل خواندن هستند. بنابراین، هر دو تکنیک باید با هم برای ایمن کردن حفاظت از داده ها استفاده شوند.